賽默飛NanoDrop Eight是一款高通量微量分光光度計(jì),能夠在190~850 nm波長(zhǎng)范圍內(nèi)快速測(cè)定核酸、蛋白及其他生物樣品的濃度與純度。其核心優(yōu)勢(shì)是:
微量上樣:僅需1~2 μL樣品即可完成檢測(cè);
多通道檢測(cè):可同時(shí)分析8個(gè)樣品,極大提高效率;
自動(dòng)光程調(diào)節(jié):通過(guò)0.2 mm與1.0 mm光程切換,覆蓋更寬濃度范圍;
直讀結(jié)果:自動(dòng)計(jì)算濃度并提供純度比值。
在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中,NanoDrop Eight廣泛用于DNA提取、RNA定量、蛋白純化質(zhì)量判定以及下游實(shí)驗(yàn)(PCR、測(cè)序、轉(zhuǎn)染等)的樣品質(zhì)量把控。因此,建立一套完善的質(zhì)量控制體系,是確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果可靠的關(guān)鍵。
質(zhì)量控制(Quality Control, QC)在NanoDrop Eight檢測(cè)中起到以下作用:
保證數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性:減少因操作誤差、樣品污染或設(shè)備波動(dòng)導(dǎo)致的偏差;
提升實(shí)驗(yàn)可重復(fù)性:相同樣品在不同批次檢測(cè)中應(yīng)得到一致結(jié)果;
確保下游實(shí)驗(yàn)順利進(jìn)行:高質(zhì)量的核酸或蛋白樣品是分子克隆、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)的前提;
符合實(shí)驗(yàn)室規(guī)范:科研與檢測(cè)機(jī)構(gòu)需符合GLP、ISO等質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn),NanoDrop檢測(cè)數(shù)據(jù)往往作為樣品質(zhì)量憑證。
核酸:提取后應(yīng)避免蛋白和鹽類殘留,可通過(guò)柱式純化或酚氯仿抽提進(jìn)一步去除雜質(zhì)。
RNA:需在無(wú)RNA酶環(huán)境中操作,保持樣品完整性。
蛋白:樣品緩沖液應(yīng)透明無(wú)渾濁,避免含有過(guò)量去垢劑或高鹽。
每次上樣量:1.5~2.0 μL,確保完全覆蓋檢測(cè)窗口。
避免氣泡:氣泡會(huì)導(dǎo)致光路異常,造成結(jié)果偏差。
樣品混勻:濃度不均勻會(huì)導(dǎo)致不同孔位結(jié)果差異大。
檢測(cè)后清潔:用無(wú)絨紙巾輕輕擦拭,避免殘留造成交叉污染。
使用與樣品相同緩沖液作為Blank,扣除背景信號(hào)。
每一批樣品檢測(cè)前均需進(jìn)行一次空白校正。
NanoDrop Eight采用氘燈與鎢燈組合光源,190~850 nm全覆蓋。
定期校驗(yàn)光源強(qiáng)度,避免因燈絲衰減導(dǎo)致基線漂移。
確認(rèn)自動(dòng)光程切換功能正常,防止?jié)舛冗^(guò)高時(shí)出現(xiàn)信號(hào)飽和。
選擇檢測(cè)模式(核酸、蛋白、多肽、熒光等);
進(jìn)行空白校正;
依次加載樣品,獲取吸光度曲線與濃度數(shù)值;
系統(tǒng)自動(dòng)給出純度比值和質(zhì)量評(píng)價(jià)。
核酸:
A260/A280 = 1.8~2.0 → 高純度DNA或RNA
A260/A230 > 2.0 → 雜質(zhì)少,適合下游實(shí)驗(yàn)
蛋白:
A280吸收峰清晰,無(wú)額外干擾峰
濃度在實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)范圍內(nèi)
NanoDrop Eight通過(guò)光程自動(dòng)調(diào)節(jié),保證了高濃度與低濃度樣品的準(zhǔn)確檢測(cè)。但仍需遵循:
樣品濃度應(yīng)在0.1~1.5 A的線性范圍;
結(jié)果最好取三次測(cè)量平均值,減少偶然誤差。
核酸:
A260/A280 < 1.8:蛋白或酚污染
A260/A230 < 2.0:鹽、碳水化合物或緩沖液殘留
蛋白:
280 nm有明顯吸收峰,若在230 nm有額外峰值,可能為緩沖液干擾。
不僅要看數(shù)值,還需查看光譜:
DNA/RNA應(yīng)在260 nm有明顯吸收峰;
蛋白應(yīng)在280 nm有峰;
若出現(xiàn)異常雙峰或雜散峰,應(yīng)懷疑有污染。
原因:上樣不均、氣泡、窗口未清潔
解決:確保移液準(zhǔn)確、及時(shí)擦拭檢測(cè)窗口
原因:樣品降解或濃度超出檢測(cè)下限
解決:檢查樣品完整性,必要時(shí)濃縮處理
原因:蛋白污染
解決:柱式純化去除蛋白殘留
原因:鹽或有機(jī)溶劑殘留
解決:乙醇沉淀或二次洗滌
原因:窗口殘留物或交叉污染
解決:每次測(cè)量后徹底清潔
明確NanoDrop Eight檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)操作流程
包含:開(kāi)機(jī)校準(zhǔn)、樣品制備、上樣規(guī)范、數(shù)據(jù)記錄、清潔維護(hù)
使用標(biāo)準(zhǔn)DNA或BSA溶液進(jìn)行方法學(xué)驗(yàn)證
每月進(jìn)行一次光源校準(zhǔn),保證結(jié)果穩(wěn)定
所有檢測(cè)結(jié)果需保存至LIMS或數(shù)據(jù)庫(kù)
保證數(shù)據(jù)可追溯,符合實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量管理要求
新進(jìn)實(shí)驗(yàn)人員需經(jīng)過(guò)NanoDrop操作培訓(xùn)與考核
定期復(fù)訓(xùn),減少人為操作偏差
NanoDrop Eight作為高通量微量分光光度計(jì),在核酸、蛋白及多種生物樣品的質(zhì)量檢測(cè)中發(fā)揮著重要作用。其結(jié)果不僅用于濃度測(cè)定,更是下游實(shí)驗(yàn)成功與否的重要前提。
要實(shí)現(xiàn)可靠的檢測(cè),必須在以下環(huán)節(jié)實(shí)施質(zhì)量控制:
樣品制備與上樣的規(guī)范化;
空白校正與光源穩(wěn)定性的監(jiān)測(cè);
數(shù)據(jù)解讀中的純度比值與光譜曲線分析;
實(shí)驗(yàn)室SOP、校準(zhǔn)、數(shù)據(jù)管理與人員培訓(xùn)的制度化建設(shè)。
通過(guò)全流程質(zhì)量控制,NanoDrop Eight不僅能提供快速高效的檢測(cè)結(jié)果,更能保證實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的真實(shí)性與可靠性,為科研和臨床應(yīng)用提供堅(jiān)實(shí)的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。
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