Applied Biosystems 7500 實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(ABI 7500)是賽默飛(Thermo Fisher Scientific)推出的經(jīng)典實(shí)時(shí)PCR平臺(tái)之一,廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)研究、分子診斷、病原體檢測(cè)及基因定量分析等領(lǐng)域。該儀器具備高靈敏度檢測(cè)能力、穩(wěn)定的熱循環(huán)系統(tǒng)和成熟的軟件操作平臺(tái),能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)核酸樣本的高效擴(kuò)增與實(shí)時(shí)熒光監(jiān)測(cè)。
熟練掌握ABI 7500的操作流程,不僅有助于實(shí)驗(yàn)成功,也能確保數(shù)據(jù)質(zhì)量和實(shí)驗(yàn)重復(fù)性。以下內(nèi)容將從設(shè)備準(zhǔn)備、實(shí)驗(yàn)設(shè)置、反應(yīng)體系搭建、運(yùn)行過(guò)程、數(shù)據(jù)分析、常見(jiàn)問(wèn)題處理與儀器維護(hù)七大模塊系統(tǒng)介紹該儀器的使用方法。
確保儀器放置在干燥、無(wú)震動(dòng)的環(huán)境中;
環(huán)境溫度建議維持在18℃~25℃,濕度控制在60%以下;
避免直射光和強(qiáng)磁干擾;
儀器后方預(yù)留通風(fēng)空間不少于10厘米。
打開(kāi)主機(jī)電源,系統(tǒng)自檢開(kāi)始;
啟動(dòng)連接的計(jì)算機(jī),打開(kāi)ABI 7500專(zhuān)用軟件;
軟件啟動(dòng)后,自動(dòng)連接儀器,顯示“Ready”狀態(tài)。
設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)前需明確以下要素:
檢測(cè)目的(基因表達(dá)、絕對(duì)定量、病原檢測(cè)等);
熒光方法(SYBR Green法或TaqMan探針?lè)ǎ?/p>
靶標(biāo)基因與參考基因序列;
引物及探針設(shè)計(jì)需考慮特異性、Tm值、二聚體風(fēng)險(xiǎn);
實(shí)驗(yàn)設(shè)置包括樣本數(shù)、技術(shù)重復(fù)、標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)組數(shù)等。
組分 | 體積(μL) |
---|---|
2× Master Mix | 10 |
正向引物(10 μM) | 0.4 |
反向引物(10 μM) | 0.4 |
探針(10 μM) | 0.2(TaqMan) |
模板DNA | 2 |
ROX染料(如需) | 0.4 |
無(wú)RNA酶水 | 補(bǔ)足至20 μL |
注:ROX染料濃度根據(jù)使用的反應(yīng)體系調(diào)整為L(zhǎng)ow ROX或High ROX,具體根據(jù)試劑說(shuō)明書(shū)配置。
使用專(zhuān)用光學(xué)96孔板或八聯(lián)排管;
用移液器準(zhǔn)確加樣,避免氣泡;
用光學(xué)膜封板,確保密封良好;
離心片刻,使液體集中在孔底。
ABI 7500軟件提供友好的人機(jī)交互界面,支持實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、運(yùn)行監(jiān)控與數(shù)據(jù)分析功能。
打開(kāi)“7500 SDS Software”;
點(diǎn)擊“File” → “New Experiment”;
選擇實(shí)驗(yàn)類(lèi)型:Standard Curve、Relative Quantitation、Genotyping 等;
命名文件并保存。
默認(rèn)熱循環(huán)程序如下:
階段 | 溫度 | 時(shí)間 | 循環(huán)數(shù) |
---|---|---|---|
初始變性 | 95℃ | 10分鐘 | 1 |
變性 | 95℃ | 15秒 | 40 |
退火/延伸 | 60℃ | 1分鐘 | 40 |
如為Fast模式,可將退火/延伸縮短至30秒;
反應(yīng)程序可自定義保存并復(fù)用。
切換至“Plate Setup”頁(yè)面;
錄入樣本名稱(chēng)、靶基因名稱(chēng);
選擇每孔的檢測(cè)通道(FAM、VIC等);
設(shè)置是否包含標(biāo)準(zhǔn)樣、陰性對(duì)照、參考基因等。
確認(rèn)樣本板放入儀器;
點(diǎn)擊“Start Run”,儀器自動(dòng)執(zhí)行程序;
可實(shí)時(shí)查看熒光信號(hào)曲線(xiàn),監(jiān)測(cè)擴(kuò)增情況。
擴(kuò)增曲線(xiàn)應(yīng)呈“S”型;
曲線(xiàn)平滑、Ct值間隔一致,代表擴(kuò)增效率正常;
若觀察到多個(gè)平臺(tái)或抖動(dòng),需排查試劑質(zhì)量或移液?jiǎn)栴}。
軟件自動(dòng)識(shí)別基線(xiàn)與閾值,生成Ct值;
若使用標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)法,可查看標(biāo)準(zhǔn)品線(xiàn)性關(guān)系與斜率;
標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)效率理想值為90%~110%(斜率 -3.1至 -3.6)。
選擇參考基因與校準(zhǔn)樣本;
系統(tǒng)自動(dòng)計(jì)算ΔCt、ΔΔCt與表達(dá)倍數(shù)變化(2^–ΔΔCt);
可視化柱狀圖輔助表達(dá)差異觀察。
結(jié)果可導(dǎo)出為Excel、CSV、PDF等格式;
可生成多圖合一實(shí)驗(yàn)報(bào)告,便于保存與發(fā)表。
引物長(zhǎng)度18-25 bp,Tm值在58-60℃;
避免重復(fù)序列、GC尾端或強(qiáng)互補(bǔ)序列;
探針應(yīng)設(shè)計(jì)在引物中間區(qū)域,防止與引物重疊。
使用校準(zhǔn)移液器;
每次更換槍頭;
盡量避免產(chǎn)生氣泡;
同一批次樣品按固定順序加樣。
使用原裝光學(xué)膠膜;
板面封膜后建議在3000 rpm下離心30秒;
防止揮發(fā)、氣泡或樣品不均影響擴(kuò)增曲線(xiàn)。
問(wèn)題現(xiàn)象 | 可能原因 | 解決方案 |
---|---|---|
無(wú)擴(kuò)增曲線(xiàn) | 模板濃度過(guò)低、酶失活 | 檢查模板質(zhì)量,更新試劑 |
多條非特異曲線(xiàn) | 引物設(shè)計(jì)不良 | 優(yōu)化引物或提高退火溫度 |
Ct值漂移大 | 加樣誤差大 | 增加技術(shù)重復(fù),精準(zhǔn)操作 |
曲線(xiàn)突跳或平臺(tái)異常 | 光學(xué)干擾或氣泡 | 確保耗材干凈、樣品無(wú)氣泡 |
每次實(shí)驗(yàn)結(jié)束后,清理熱循環(huán)模塊,用無(wú)塵布擦拭殘留物;
每周檢查熱蓋壓力、散熱風(fēng)扇運(yùn)行是否正常;
每月進(jìn)行軟件備份、系統(tǒng)校準(zhǔn)確認(rèn);
定期聯(lián)系廠(chǎng)家進(jìn)行年度光學(xué)系統(tǒng)校準(zhǔn)與維護(hù);
避免重復(fù)使用老化的光學(xué)板或損壞耗材,確保熒光信號(hào)穩(wěn)定性。
Applied Biosystems 7500 實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀作為一款經(jīng)典的qPCR平臺(tái),憑借其成熟的系統(tǒng)構(gòu)架、穩(wěn)定的反應(yīng)條件和直觀的軟件設(shè)計(jì),為生命科學(xué)與臨床檢測(cè)提供了高質(zhì)量的核酸定量解決方案。掌握其標(biāo)準(zhǔn)化操作流程與優(yōu)化策略,不僅可以提高實(shí)驗(yàn)效率,也能確保實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性與可重復(fù)性。
對(duì)于科研人員而言,該設(shè)備是日?;虮磉_(dá)分析、病原檢測(cè)、SNP分析等工作的強(qiáng)大工具。而對(duì)于臨床實(shí)驗(yàn)室,它則是建立標(biāo)準(zhǔn)核酸檢測(cè)流程的重要平臺(tái)。通過(guò)科學(xué)管理與合理維護(hù),ABI 7500將持續(xù)為實(shí)驗(yàn)室工作提供穩(wěn)定支持。
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